Межрегиональная общественная организация содействия развитию неонатологии «Ассоциация неонатологов» была создана и зарегистрирована 22 января 2013 года в форме регионального общественного объединения в городе Москве.

16 февраля 2016 года переименована в Общероссийская общественная организация содействия развитию неонатологии »Российское общество неонатологов» .

В настоящее время региональные отделения работают в 46 субъектах Российской Федерации; в Ассоциации насчитывается более 2200 членов, почти из всех регионов России. 

Региональное отделение в Алтайском крае начало свою работу с декабря 2015 года.